Il est très simple d’ajouter, dans un script R, les noms des packages aux appels des fonctions. Sous forme de préfixes, ces indications permettent de repérer les packages utilisés et donc faciliter la reproductibilité de l’analyse. Nous prenons ici l’exemple d’un script générant un nuage de mots à…

Nous allons montrer comment réaliser des cartes avec R à l’aide du package mapsf (T.Giraud) et du packages sf. mapsf est un outil très utile pour manipuler et visualiser des données spatiales en R, tandis que le package “sf” fournit une infrastructure pour stocker et manipuler ce type…

Si Iramuteq est un logiciel pratique, qui permet à un public peu familier des logiciels statistiques de faire des analyses textuelles, l’étape de création du corpus de texte peut présenter quelques difficultés. C’est plus particulièrement le cas lorsque le corpus est directement récupéré en…

Pour réaliser un nuage ou un graphe de mots avec R, l’utilisation des packages R.temis, dplyr et tibble s’avèrent particulièrement utiles. Le package R.temis fournit des fonctions pour les traitements de statistiques textuelles comme la création d’un tableau lexical ou le…

Nous allons montrer comment s’approprier des données issues des Enquêtes Démographiques et de Santé (DHS) pour produire des statistiques univariées avec R.

Un graphique devient très facilement illisible lorsque trop d’objets graphiques y sont introduits, par exemple pour des courbes, au-delà de 5-6. Ce problème est appelé effet spaghetti (effet paella pour un nuage de points). Pour contrôler cette difficulté il est préconiser de réaliser un…

Rstudio possède des Addins qui permettent d’exécuter des fonctions R de façon interactive. Le code généré peut être sauvegardé pour l’insérer dans ses scripts R. Nous illustrons notre propos ici avec les packages esquisse pour visualiser des données ou produire des graphiques simples et…

On peut utiliser R avec le très populaire notebook Jupyter. Utilisé dans un navigateur, il permet de récupérer l’ensemble des cellules et les enregistrer dans un programme unique .R. Cette fiche décrit les différentes étapes pour utiliser ce notebook avec R, dans un navigateur ou avec l’Ide…

Après avoir explorer des données, on peut vouloir compiler nos tables dans un même objet et l’exporter dans Excel pour les mettre en forme selon ses goûts. Il est possible d’automatiser le processus sur R.

L’utilisation des poids normalisés sur la taille de l’échantillon s’avère obligatoire pour certaines analyses, en particulier pour obtenir des estimations robustes de la variance. La présente fiche présente avec les packages questionr et survey, deux manières d’introduire ces poids dans des…

Le format JSON est un format de plus en plus utilisé pour stocker des données, notamment pour les données issues du web. Cependant, sa structure particulière peut poser des problèmes pour obtenir un dataframe dans R.

Lors du nettoyage des données, on peut être amené à appliquer le même recodage à plusieurs variables aux modalités similaire (valeurs manquantes, Ne sait pas, Batterie de variables semblables, … ). Pour éviter de copier-coller un même code, on peut facilement automatiser le processus sur R.

Lors d’un recodage d’une variable, on peut être emmené à créer des catégories dépendantes d’une ou plusieurs conditions. Pour cela, la plus part des logiciels permettent des fonctions qui suivent le schéma : SI condition ALORS catégorie1 SINON catégorie2. Sur R, plusieurs possibilités s’offrent à…

En démographie historique, on est souvent amenés à confronter des chaines de caractères pour relier des enregistrements nominatifs, par exemple chaîner des actes BMS (Baptême-Mariage-Sépulture) pour essayer de retrouver le parcours d’un…

La fonction summ du package jtools (Jacob Long) permet d’obtenir des outputs de regression en format console de très bonne qualité. Il s’agit d’une très bonne alternative aux outputs par défaut. Ce package propose également des fonctionnalités d’exportation des outputs dans d’autres formats…

Comment récupérer la variante du test de Grambsch-Therneau implémentée au package survival avant son passage à la v3. Permet de s’assurer une reproductibilité avec les autres applications statistiques (Stata, Sas, Python) avec des durées discrètes.

VSCode est un IDE (Environnement de Dévelopement Integré) qui offre une intégration avec de nombreux outils et langages de programmation. L’extension R pour VS Code vous permet de travailler avec R dans un environnement de développement intégré, ce qui peut vous faire gagner du temps. VS Code…

Le formatage d’un document utilisant du markdown ne permet pas de modifier à la volée la couleur d’un mot ou d’un texte. Classiquement on utilise soit un balisage html, soit une définition d’un style qui sera affectée à du texte, directement dans un document ou dans un fichier .css. On peut encore…

Par rapport à Github le déploiement de contenus html sur Gitlab sans compte associé de type humanum pour la recherche en sciences sociales, demande quelques manipulations supplémentaires. Les éléments qui suivent donnent la marche à suivre, sous forme de pas à pas. Ces opérations se font sans…

Le paquet de retranscription d’un fichier audio Whisper demande l’installation de l’encodeur vidéo ffmpeg. Même installé, le chemin d’accès de ffmpeg doit être impérativement présent dans les variables d’environnement.

Par défaut, tous les styles et les images associés à une page html générée avec Quarto sont enregistrés dans un répertoire distinct. Si on souhaite transmettre une simple page de résultats ou un descriptif de programme à ses collègues, on doit transmettre l’intégralité de ces fichiers. Avec…

Sous forme de gifs animés: création d’un dépôt git, création d’un projet Rstudio avec clonage du dépôt, envoyer des fichiers du projet dans le dépôt.

A la suite d’un code, le report de l’output console de Quarto (idem Rmarkdown) épouse le thème de la page. Il est possible de modifier son apparence, comme la couleur de fond et la présence d’un contour, à l’aide des variables sass et d’un code .css ajoutés à un fichier .scss

Depuis la version 1.3 de Quarto il est possible d’annoter une ou plusieurs lignes d’un bloc de codes.

L’extension social-embeds permet d’insérer proprement du contenu provenant de médias sociaux à l’aide d’un code très simple qui est directement ajouté à la page qmd. La seule opération consiste à récupéré l’identifiant de la vidéo, d’un post provenant d’un média tel que twitter ou…

Certains fichiers, en apparence vide de contenu, semblent non modifiable, et donc non supprimable. Cela empêche, entre autres, d’effacer un répertoire. C’est le cas des fichiers nul, qui sont créés assez régulièrement chez moi avec Quarto.