Commenter des lignes de codes

Quarto
Code
Auteur·rice
Affiliation

Marc Thévenin

Ined

Date de publication

16 juin 2023

Résumé

Depuis la version 1.3 de Quarto il est possible d’annoter une ou plusieurs lignes d’un bloc de codes.

```r 
# Dans le bloc de codes
library(readr)                                                                                                    # <1>
library(survival)                                                                                                 
library(survminer)                                                                                                
                       
df <- read.csv("https://raw.githubusercontent.com/mthevenin/analyse_duree/master/bases/transplantation.csv")      # <2>

fit <- survfit(Surv(stime, died) ~ 1, data = df )                                                                 # <3>

ggsurvplot(fit, conf.int = TRUE, risk.table = TRUE)                                                               # <4>

```
# Dans le corp du document .qmd à la suite du bloc

1. Chargement des packages
2. Chargement de la base
3. Calcul des estimateurs de Kaplan-Meier
4. Graphique de la fonction de survie avec `ggsurvplot`

Donne le rendu suivant:

1library(readr)
library(survival)                                                                                                 
library(survminer)                                                                                                
                       
2df <- read.csv("https://raw.githubusercontent.com/mthevenin/analyse_duree/master/bases/transplantation.csv")

3fit <- survfit(Surv(stime, died) ~ 1, data = df )

4ggsurvplot(fit, conf.int = TRUE, risk.table = TRUE)
1
Chargement des packages
2
Chargement de la base
3
Calcul des estimateurs de Kaplan-Meier
4
Graphique de la fonction de survie avec ggsurvplot

Par défaut, les commentaires s’affichent en dessous du bloc. Deux autres options sont disponibles, qui affichent le commentaire à droite de chaque ligne: une en passant sur la ligne( code-annotations: over) et une en cliquant sur la ligne code-annotations: select).

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title: "titre page"
code-annotations: select
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